Die ITX-Boards die ich kenne benötigen nur eine Betriebsspannung und erstellen sich die anderen benötigten selbst.
Anders die Laufwerke. Will man eine Festplatte nutzen benötigt diese natürlich weiterhin 12V und 5 V.
Also im Zweifelsfall dafür ein separates Netzteil oder ein \"großes\" Netzteil nehmen.
Ein Workaraund wäre, die Festplatten in Gehäuse für externe USB-Platten stecken, die haben ja ein Steckernetzeil dabei und einfach mit einen Kabel direkt am Board anschließen, also nicht per USB.
Gibt da auch entsprechende Adapter für.
Gute (ITX-)Netzteile gibt es übrigens hier:
http://www.techcase.net