Das liegt wohl eher an der Halskrümmung.... bevor du den Abstand zwischen Saite und Griffbrett auf Golden-Gate-Niveau vergrösserst, schau dir den Hals mal genau an.
Schau ganz dicht übers Kopfbrett den Hals entlang Richtung Pickups. Der Hals sollte möglichst gerade, mit einer ganz ganz feinen Einwärtskrümmung um den 12. Bund herum, sein.
Falls es nicht an der Halskrümmung liegt, könnte die Ursache auch eine schlechte Sattelkerbe für diese Saite sein. Den Strats-Nachbauten traue ich alles mögliche zu.
By the Way: Auch bei mir schnarrt die tiefe E-Saite, weil ich eine eher flache Saitenlage bevorzuge. So what!
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Gruss aus der Schweiz
Tom